無菌室一般為4 - 5 平方米、高 2.5 米的獨立小房間(與外間隔離)，專辟于微生物實驗室內(nèi)，采用易清潔的凈化板材搭建。

無菌室外要設(shè)一個緩沖間，錯開門向，以免氣流帶進雜菌。無菌室和緩沖間都必須密閉、室內(nèi)裝備的換氣設(shè)備必須有空氣過濾裝置。在獲得了無菌環(huán)境和無菌材料后，只有保持無菌狀態(tài)，才能對某種特定的已知微生物進行研究。所以控菌能力和控菌穩(wěn)定性是無菌室的核心驗收指標。業(yè)內(nèi)通行的驗收標準為100級潔凈區(qū)平板雜菌數(shù)平均不得超過1個菌落，10000級潔凈室平均不得超過3個菌落，但由于持續(xù)穩(wěn)定性難以測試，所以國內(nèi)工程企業(yè)經(jīng)常出現(xiàn)3年翻新現(xiàn)象，導(dǎo)致性價比縮水;而國際品牌工程，由于普遍按歐美環(huán)境指標執(zhí)行，很難考慮國內(nèi)建筑材料適應(yīng)性，所以也經(jīng)常發(fā)生穩(wěn)定性失常狀況。在通行標準之外，還設(shè)有自身執(zhí)行的長期維護、選材指標，凈化能力和環(huán)境適應(yīng)力遠超國際品牌。